این هنرمند نوازندگی دوتار را از سن 20 سالگی شروع و با علاقه وافری كه نسبت به این هنر داشت مراتب تكمیلی را فرا گرفت و از محضر اساتیدی چون مرحوم سلطان رضا گلیانی و مختار زنبیلباف بهره برد.
باقری در سالهای آغازین انقلاب اسلامی با حضور در رادیو خراسان،قطعاتی حماسی درباره انقلاب اسلامی را اجرا كرد كه جزو ماندگارترین آثار وی به شمار میرود.این هنرمند علاوه بر نوازندگی از سنین نوجوانی به سرودن اشعار بومی پرداخت و اشعار بسیاری از آهنگهای خود را نیز میسرود.
استاد محمد ابراهیم باقری در آخرین اثر خود كه در آلبوم موسیقی «ایرانم» تولید حوزه هنری خراسان شمالی منتشر شده است،قطعه «كشور من ایران» را با شعر سروده خودش،اجرا كرده است.